EpiMark® N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒 货 号 #E1610S-NEB酶试剂

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产品资料 – 表观遗传学 – 表观遗传学

EpiMark® N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒                              收藏

EpiMark® N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒             货   号                  #E1610S

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#E1610S
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特性

 在免疫沉淀实验流程中富集经 m6A 修饰的 RNA

 经富集的 RNA 可直接用于 NGS 或 RT-qPCR

概述

 EpiMark N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒包含一个 N6– 甲基腺苷(m6A)兔源单克隆抗体。试剂盒中含有 2 个对照RNA,一个含有 m6A 修饰(Gaussia 荧光素酶),另一个不含 m6A 修饰(Cypridina 荧光素酶)用于监测富集和消耗程度。其中,GLuc RNA 对照在转录过程中需 20% 的 m6ATP 和 80% 的 ATP。

 

该试剂盒可用于在免疫沉淀实验流程中富集经 m6A 修饰的 RNA,可用于 NGS 或 RT-qPCR 等下游实验。在片段化的 RNA 样本中,经修饰的 RNA 可与 N6– 甲基腺苷抗体结合,从而被与抗体结合的 Protein G 磁珠富集。再经多轮洗涤与纯化步骤后,富集的 RNA 洗脱于无核酸酶水中,可用于进一步的分析。

EpiMark N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒组分

 – N6–甲基腺苷抗体

– m6A 修饰的对照 RNA(100 nM)
– 无修饰的对照 RNA(100 nM)

参考文献

 有关该产品特性和应用的参考文献请联系我们。

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒 货 号 #E2600S-NEB酶试剂

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产品资料 – 表观遗传学 – 表观遗传学

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒                              收藏

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒             货   号                  #E2600S

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#E2600S
25 次反应
5,389.00

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特性

 高亲和性以确保最佳灵敏度
 小体积洗脱,简化下游应用
 简单明了的实验步骤,2 小时内完成富集
 富集的甲基化 DNA 易与双链接头连接,进行高通量测序
 较宽泛的样品起始 DNA 浓度,均可得到高纯度富集产物

概述

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒可有效的富集基于 CpG 密度的双链 CpG 甲基化 DNA。该试剂盒利用人 MBD2a 蛋白的甲基-CpG 结合域作为捕获诱饵,并将该结合域与人 IgG1 的 Fc 尾部融合表达形成 MBD2a-Fc 复合蛋白,再偶联上 ProteinA 磁珠形成 MBD2a-Fc/Protein A 磁珠复合物。这个稳定的复合物可以选择性的结合 CpG 甲基化的双链 DNA。高亲和性的磁珠与优化的试剂相配合,极大的提高了灵敏度和精确性。试剂盒提供所有所需试剂,2 小时内就能完成 4 步富集反应。
EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒             货   号                  #E2600S

 

EpiMark 甲基化 DNA 富集试剂盒包括

– MBD2-Fc 蛋白
– Protein A 磁珠
– 结合/洗涤缓冲液
– 高盐洗脱缓冲液
– 片段化 HeLa DNA
– Line element 引物(作为甲基化基因座对照)
– RPL30 引物(作为非甲基化基因座对照)
– MirA 基因座对照引物

参考文献

有关该产品性质和应用的参考文献请联系我们。

5-甲基化-dCTP 货 号 #N0356S-NEB酶试剂

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产品资料 – 表观遗传学 – NEBNext ChIP-Seq文库制备试剂

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#N0356S
1 μmol (0.1 ml)
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特性

 生成胞嘧啶完全甲基化的 DNA

概述

胞嘧啶的甲基化修饰(C5)是一种非常重要的表观遗传学修饰。该修饰也被认为是TET(Ten-Eleven Tra-nslocation)家族蛋白及其协同的氧化途径的起始底物。5-甲基-dCTP 可以通过酶促反应将其自身掺入到  DNA 中,获得完全甲基化的胞嘧啶 DNA,该产品适用于各种生物化学及细胞学研究。
 
5-甲基-dCTP(2´ -脱氧-5-甲基胞苷 5´ 三磷酸)以溶液形式提供,浓度为 10 mM,pH 7。用 A260 测定核苷酸浓度。

分子式

C10H15N3O13P3(无酸)

浓度

10 mM 溶液。

分子量

481.1(按酸的形式)。

稀释兼容性

用无菌蒸馏水稀释,Milli-Q® 处理的水稀释最佳,或用无菌 TE [10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA (pH 7.5)]。

质保声明

5-甲基-dCTP 不含核酸酶和磷酸酶。

5-甲基化-dCTP 货 号 #N0356S-NEB酶试剂

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产品资料 – DNA聚合酶与扩增技术 – 核苷酸溶液和缓冲液

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#N0356S
1 μmol
859.00

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概述

dNTP 套装:
四种独立包装的超纯脱氧核苷三磷酸的溶液(dATP、dCTP、dGTP 和 dTTP)。每种的浓度为 100 mM。

dNTP 混合液:
含相同摩尔数的超纯 dATP、dCTP、dGTP 和 dTTP。每种的浓度为 10 mM。

rNTP 套装:
四种独立包装的核苷三磷酸溶液(ATP、CTP、GTP 和 UTP),pH 7.5,以钠盐形式存在。

rNTP 混合液:
含相同摩尔数的四种核苷三磷酸:rATP、rCTP、rGTP 和 rUTP。每种浓度为 25 mM(rNTP 总浓度相当于 100 mM)。

7-去氮-dGTP:
含有 5 mM 7-去氮-dGTP 的二锂盐溶液。

5-甲基-dCTP:
10 mM 溶液,pH 7.0。

dATP 溶液:

含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。

acyNTP 套装:
四种独立包装的 acyNTP (acyATP、acyCTP、acyGTP 和 acyTTP)。以干粉形式提供,加入 50 μl 蒸馏水或去离子水(Milli-Q®)后,acyNTP 的终浓度为 10 mM。

acyNTP 可作为链终止基团,因而可用于一般采用 ddNTP 的实验,如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应,特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后,拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力,这些类似物的糖环发生了改变,如 rNTP,ddNTP,2´ 脱氧核苷酸,特别是 acy 碱基类似物。  

参考文献

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NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 货 号 #E7120L-NEB酶试剂

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

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概述

虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准,但这种转化方式会对DNA 造成损伤,导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理 DNA (WGBS) 的方法,并结合高效流程化的建库步骤,适用于 Illumina 平台测序。高效的 EM-Seq 酶促转化可最大程度地减少对DNA的损伤,结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程,最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 5-hmC

优势

更卓越的 5-mC 5-hmC 检测灵敏度

更高的比对率

更均一的 GC 覆盖度

能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点

更均一的二核苷酸分布

更长的文库插入片段

更高效的建库流程

提供转化模块

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

产品特点

 NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

EM-Seq 能得到更高的文库产量。采用Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量,EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量,表明 EM-Seq 显著减少了 WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 器将 50 ng NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序,片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据,结果如图:EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长,说明:酶学转化法不会对 DNA 造成损伤,而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

 

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点,并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。

A: CpG 位点检测:通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度,其中每条链都独立计数,最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示:EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。

B: GC 覆盖度:使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度,图中显示不同 GC 含量时 (0-100%),标准化后覆盖度的分布情况。结果显示:EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性,无 AT 过度测序,也无 GC 测序不足,后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 60002 X 100 bases)测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。

图中显示了 EM-Seq WGBS 两种方法在不同起始量,至少 1X 8X 测序深度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下,CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

 

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块 货 号 #E7125L-NEB酶试剂

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于Illumina测序平台: 模块和酶

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块                              收藏

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概述

虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准,但这种转化方式会对DNA 造成损伤,导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理 DNA (WGBS) 的方法,并结合高效流程化的建库步骤,适用于 Illumina 平台测序。高效的 EM-Seq 酶促转化可最大程度地减少对DNA的损伤,结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程,最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 5-hmC

优势

更卓越的 5-mC 5-hmC 检测灵敏度

更高的比对率

更均一的 GC 覆盖度

能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点

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NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块            货   号                  #E7125L

产品特点

 NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块            货   号                  #E7125L

EM-Seq 能得到更高的文库产量。采用Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量,EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量,表明 EM-Seq 显著减少了 WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块            货   号                  #E7125L

NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 器将 50 ng NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序,片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据,结果如图:EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长,说明:酶学转化法不会对 DNA 造成损伤,而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

 

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块            货   号                  #E7125L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点,并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。

A: CpG 位点检测:通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度,其中每条链都独立计数,最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示:EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。

B: GC 覆盖度:使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度,图中显示不同 GC 含量时 (0-100%),标准化后覆盖度的分布情况。结果显示:EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性,无 AT 过度测序,也无 GC 测序不足,后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块            货   号                  #E7125L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 60002 X 100 bases)测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。

图中显示了 EM-Seq WGBS 两种方法在不同起始量,至少 1X 8X 测序深度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下,CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

 

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物) 货 号 #E7140L-NEB酶试剂

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于Illumina测序平台: 模块和酶

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概述

虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准,但这种转化方式会对DNA 造成损伤,导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理 DNA (WGBS) 的方法,并结合高效流程化的建库步骤,适用于 Illumina 平台测序。高效的 EM-Seq 酶促转化可最大程度地减少对DNA的损伤,结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程,最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 5-hmC

优势

更卓越的 5-mC 5-hmC 检测灵敏度

更高的比对率

更均一的 GC 覆盖度

能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点

更均一的二核苷酸分布

更长的文库插入片段

更高效的建库流程

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NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物)            货   号                  #E7140L

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NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物)            货   号                  #E7140L

NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 器将 50 ng NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序,片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据,结果如图:EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长,说明:酶学转化法不会对 DNA 造成损伤,而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

 

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物)            货   号                  #E7140L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点,并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。

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B: GC 覆盖度:使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度,图中显示不同 GC 含量时 (0-100%),标准化后覆盖度的分布情况。结果显示:EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性,无 AT 过度测序,也无 GC 测序不足,后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物)            货   号                  #E7140L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 60002 X 100 bases)测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。

图中显示了 EM-Seq WGBS 两种方法在不同起始量,至少 1X 8X 测序深度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下,CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

 

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(甲基化接头,12 种) 货 号 #E7535L-NEB酶试剂

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(甲基化接头,12 种)                              收藏

货 号
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#E7535L
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#E7535S
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产品特点

·提高连接效率
·极大降低接头二聚体
·增加文库产量 
·增加样品识别特异性 (双端检索)
·大量单端检索/可用检索 
·提供检索表和样本示例表

概述

NEBNext 接头是为 DNA、ChIP DNA 和 RNA(不包括 Small RNA)文库构建而设计的,能够确保接头的高效连接及文库的高产量,并且最大限度的减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头包含一个特殊的发卡环状结构,能够更高效的和经末端修复的带 dA 尾的 DNA 结合。环状结构包含一个 U,当 U 被 USER 酶(由 UDG 和内切酶 VIII 组合而成)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 的反应底物。检索序列通过 PCR 引入文库,从而实现了多样本的制备。NEBNext 接头引物不仅能够用于 NEBNext 产品,也可以用于其它的兼容 Illumina 标准平台的文库制备方法。

 
提供单端和双端检索引物。同时也提供用于重亚硫酸盐测序的甲基化接头。
 
NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(甲基化接头,12 种)            货   号                  #E7535L

功能验证

 每个试剂盒都通过对基因组 DNA、ChIP DNA 和 mRNA 进行文库构建,并在 Illumina 平台测序进行验证。

 

请联系我们。 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

EpiMark® N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒 货 号 #E1610S-NEB酶试剂

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产品资料 – RNA 试剂 – RNA 分离和检测

EpiMark® N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒                              收藏

EpiMark® N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒             货   号                  #E1610S

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#E1610S
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特性

 在免疫沉淀实验流程中富集经 m6A修饰的 RNA
 经富集的 RNA 可直接用于 NGS 或RT-qPCR

概述

 EpiMark® N6-甲基腺嘌呤富集试剂盒包含一个 N6-甲基腺苷(m6A)兔源单克隆抗体。试剂盒中含有2个对照 RNA,一个含有 m6A 修饰(Gaussia 荧光素酶),另一个不含 m6A 修饰 (Cypridina 荧光素酶)用于监测富集和消耗程度。其中,Gluc RNA 对照在转录过程中需 20% 的 m6ATP 和 80% 的 ATP。
该试剂盒可用在免疫沉淀实验流程中富集经 m6A 修饰的 RNA,可用于 NGS 或 RT-qPCR 等下游实验。在片段化的 RNA 样本中,经修饰的 RNA 可与 N6-甲基腺苷抗体结合,从而被于抗体结合的 Protein G 磁珠富集。再经多轮洗涤与纯化步骤后,富集的 RNA 洗脱于无核酸酶水中,可用于进一步的分析。

EpiMark N6-甲基化腺嘌呤富集试剂盒组分:

– N6-甲基腺苷抗体
– m6A 修饰的对照 RNA (100nM)
– 无修饰的对照 RNA(100 nM)

参考文献

有关该产品特性和应用的参考文献请联系我们。

N6-甲基腺苷抗体是由 Cell Signaling Technology, Inc.生产,由 New England Bio-labs, Inc. 销售。

黏蛋白染色液(温和甲基化法) D7860 染色及显色类

黏蛋白染色液(温和甲基化法) Jinpan D7860 染色及显色类
产品名称:黏蛋白染色液(温和甲基化法)
品牌:Jinpan
货号:D7860
规格:2×50ml
储存条件: 4℃,避光,6个月
用途: 区分黏蛋白中酸性基团:羧基和硫酸根
注意事项:酸性甲醇与阿利新蓝联合使用,碳水化合物含有羧基呈阴性,出现任何着色则意味着含有硫酸根。
货期:现货

黏蛋白染色液(温和甲基化法) Jinpan D7860 染色及显色类 2×50ml

 

上海金畔生物科技有限公司供应黏蛋白染色液(温和甲基化法) Jinpan D7860 染色及显色类;现货供应黏蛋白染色液(温和甲基化法) Jinpan D7860 染色及显色类量大优惠,咨询

 

黏蛋白染色液(温和甲基化法) Jinpan D7860

产品名称:黏蛋白染色液(温和甲基化法)

品牌:Jinpan

货号:D7860

规格:2×50ml

储存条件: 4℃,避光,6个月

用途: 区分黏蛋白中酸性基团:羧基和硫酸根

注意事项:酸性甲醇与阿利新蓝联合使用,碳水化合物含有羧基呈阴性,出现任何着色则意味着含有硫酸根。

货期:现货

需详细资料的请客服

Qiagen 59104 甲基化转化试剂盒;黑龙江供应Qiagen 59104 甲基化转化试剂盒

上海金畔生物科技有限公司供应Qiagen 59104 甲基化转化试剂盒量大优惠,咨询 :

Qiagen 59104 甲基化转化试剂盒

上海金畔生物科技有限公司供应Qiagen 59104 甲基化转化试剂盒量大优惠,咨询 :

全的重亚硫酸盐转化并回收DNA,用于甲基化分析
快速可靠在6小时获得实验结果
2 μg 模板可获得99%以上的转化率
*的DNA保护体系用于高度敏感的分析
经优化的操作方法可处理福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本DNA
提供离心柱或者96孔板方式

 

EpiTect Bisulfite 操作流程基于QIAGEN简单直接的结合、洗涤和洗脱体系,仅需几个简单的步骤(见流程图 EpiTect 亚硫酸氢盐转化步骤)。DNA经过热变性和亚硫酸氢盐转化后,被上样到EpiTect分离柱或96孔板上,使用优化的缓冲液和标准化的离心步骤或真空装置,洗去所有的亚硫酸氢钠并洗脱DNA。洗脱的DNA可用于各种下游应用,如:甲基特异性PCR,定量PCR分析,硫酸氢盐测序(bisulfite sequencing),结合亚硫酸氢盐的限制性内切酶法分析(COBRA)和焦磷酸测序(Pyrosequencing)。

快速得到实验结果

完整的EpiTect离心和真空过程–从DNA到待分析的亚硫酸氢盐转化后的高纯DNA–只需6小时。试剂盒提供所有必需的缓冲液和试剂,仅需很少的操作步骤。传统的亚硫酸氢盐转化过程需要18个小时,且需要大量的操作(见图“快速简单的亚硫酸氢盐转化”和 “节约时间的操作步骤”)。EpiTect Bisulfite试剂盒为成功进行亚硫酸氢盐转化和DNA回收提供所需的全部试剂。

快速简单的亚硫酸氢盐转化
 
 EpiTect
 传统操作
 
反应构建
 10 分钟, 预制溶液
 40 分钟,需反应构建
 
亚硫酸氢盐转化
 5 小时
 16 小时
 
纯化
 30-45分钟; EpiTect 离心柱或96孔板
 120 分钟;纯化、脱磺、沉淀和洗涤
 

 

*的DNA 转化
每个EpiTect Bisulfite Kit可以相同的效率转化,低至1 ng  到2 µg DNA起始样本。全新的实验步骤和优化的缓冲液可回收得到高产量的转化后DNA。当通过定量PCR扩增经转化的DNA时,低CT值的实验结果显示了高效的胞嘧啶转化(见图 “*的胞嘧啶转化”)。对转化的DNA的分析显示,EpiTect Bisulfite Kit可转化超过99%的未甲基化的胞嘧啶(见图:“高效胞嘧啶转化”)。高转化率确保了高重复性和可靠的下游分析结果。

*的DNA保护
DNA保护缓冲液采用*的配方,防止DNA过度片段化(在高温、低pH值条件下使用亚硫酸氢盐处理DNA时经常出现严重的DNA 片段化),并实现有效的DNA变性,从而产生*转化胞嘧啶时所需的单链DNA(见图“*的DNA保护缓冲夜合pH指示剂”)。防止DNA 片段化的发生可以保证后续大PCR片段的扩增和分析(见图 “zui少量模板DNA的大规模 PCR扩增”)。这一有效的完整DNA回收可保证转化后的DNA可至少保存12个月而不影响DNA的品质(见图 “DNA长期储存”)†。此外,DNA保护缓冲液包含有PH指示剂染料,从而可保证用于胞嘧啶转化的正确的pH条件。

† 更长时间的转化后DNA的保存方法正在研究中。请QIAGEN获取详细信息。

 

特殊样本的亚硫酸氢盐转化
从*样本和少量样本(如:福尔马林固定、FFPE石蜡包埋或显微切割组织)中确定甲基化模式,由于DNA的量很少,实验尤其困难。但是这些样本类型是成功鉴定有价值的疾病预测生物标记的专门研究对象。

EpiTect Bisulfite Kits 为这些类型的样本提供优化的操作流程,从而解决了难题 (见“FFPE组织样本的甲基化检测”)。

表观遗传学标准化流程
表观遗传学信息对于生物医学研究(尤其是肿瘤学),干细胞研究以及发育生物学等领域都非常重要。但是分析DNA甲基化的变化目前仍具有挑战性,因为缺乏标准化的方法可从有限的样本中得到高重现性的数据。QIAGEN推出新的表观遗传学解决方案,使样本分析前处理到分析整个过程实现标准化,即从DNA样本收集、稳定和纯化,到亚硫酸氢盐转化和定量或常规PCR甲基化分析或测序(见图“表观遗传学标准化流程”)。

应用
        使用EpiTect Bisulfite Kit转化和纯化的DNA使用与各种下游应用,如:

甲基化特异性PCR
多重PCR
定量PCR
测序/焦磷酸测序(Pyrosequencing)